ইসলামী ব্যাংকের ঋণ জালিয়াতির ঘটনায় বড় ধরনের দুর্নীতির অভিযোগ উঠেছে। সুপ্রভ কম্পোজিট নিট লিমিটেড নামক একটি দুর্বল প্রতিষ্ঠানের ঋণের সীমা জালিয়াতির আশ্রয় নিয়ে ১০০ কোটি থেকে বাড়িয়ে ৫০০ কোটি টাকায় উন্নীত করা হয়েছে। পরবর্তীতে এই বিপুল পরিমাণ অর্থ পরস্পর যোগসাজশে আত্মসাৎ করার অভিযোগে দুর্নীতি দমন কমিশনে (দুদক) একটি আনুষ্ঠানিক অভিযোগ দায়ের করেছে ব্যাংক কর্তৃপক্ষ।
অভিযুক্তদের তালিকায় রয়েছেন বিতর্কিত ব্যবসায়ী এস আলম, ইসলামী ব্যাংকের তৎকালীন পরিচালনা পর্ষদের সদস্য ও সাবেক রাষ্ট্রপতি মো. সাহাবুদ্দিন এবং ব্যাংকের সাবেক ব্যবস্থাপনা পরিচালক মনিরুল মাওলাসহ মোট ৩৮ জন ব্যক্তি। অভিযোগকারী ব্যাংক কর্তৃপক্ষের দাবি, যথাযথ প্রক্রিয়া অনুসরণ না করে এবং জালিয়াতির মাধ্যমে ব্যাংক থেকে এই অর্থ লোপাট করা হয়েছে, যা বর্তমান তদন্তে উঠে এসেছে।